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实验室新闻((,,,,Keyword Cloud)

最新消息:

***可用于博士后研究员和学生(GRA)的多个职位。请联系到zhongming.zhao@uth.tmc.edu。

关于癌症数据的有趣的AI黑客马拉松。它是免费的加奖和现金!尝试加入(注册链接传单)。

我们的最新出版物,题为“Integration of millions of transcriptomes using batch-aware triplet neural networks,“在自然机器智能上发表!自然机器智能是机器学习和人工智能中的新型高影响力日记。我们开发了INSCT,这是一种新颖的深度学习算法,以批次了解的方式整合了数百万个单细胞转录组。(06-21-2021)

我们最新的COVID-19研究工作,题为beplay苹果手机能用吗“ CXCR6与COVID-19的严重程度:描述转录组调节中的宿主遗传因素的关联”,已发表在人类遗传学上!在这项工作中,第一次我们在免疫细胞中的C-X-C基序趋化因子受体6(CXCR6)表达上确定了宿主遗传因子与COVID-19症状的严重程度有关。This finding was also reported by医学媒体并由其他一些研究提到,包括 -https://www.nature.com/articles/s41586-021-03767-x,,,,https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.01.25.428125v1.full.pdf(06-20-2021)

Zhao博士是2021年Facebase Scientific Meeting(虚拟)的演讲者。他的谈话标题:“一种用于研究颅面发育过程中转录因子和microRNA的动态共同调节的发展阶段特异性网络方法”。(06-15-2021)

赵博士已从德克萨斯州的癌症预防和研究所(CPRIT)获得近400万美元,以提供癌症的研究培训。beplay苹果手机能用吗赠款标题:生物医学信息学,基因组学和转化癌症研究培训计划(BIG-TCR)beplay苹果手机能用吗[消息]((05-19-2021)

Zhao博士已从NIH/NICDR中获得了新的R01赠款,题为“在颅面发育中解码遗传调节和细胞图的深度学习”。(04-01-2021)

PhD candidate Astrid Manuel was awarded her NIH/NLM fellowship again! Great job and well done! Congrats Astrid! (04-06-2021)

欢迎Huihui粉丝博士加入Zhao博士的实验室和CPH,担任研究助理教授!beplay苹果手机能用吗(03-22-2021)

PhD candidate Fangfang Yan received the Doris Ross Scholarship at SBMI. Congrats, Fangfang! (01-26-2021)

博士。Zhao and Pei’s abstract, “Gene expression imputation in human brain with spatiotemporal precision and cell-type specificity and its implications for 13 brain-associated disorders or traits,” was selected as the oral presentation in 2020 World Congress of Psychiatric Genetics (WCPG 2020) (10-20-2020)

欢迎Hyun-Hwan Jeong博士加入Zhao博士的实验室和CPH,担任研究助理教授!beplay苹果手机能用吗(09-01-2020)

Dr. Zhao is a speaker in Biological Psychiatry and Single Cell Omics Networking Symposium, Gulf Coast Consortia for Quantitative Biomedical Sciences, Houston, TX, 08/27/2020

Zhao博士已获得NIH/NICD的R01赠款,题为“细胞代谢在pape骨形态发生中的作用”。(多个PIS Junich Iwata博士和Zhao博士)(07-01-2020)

恭喜,阿斯特丽德!阿斯特丽德(Astrid)已被Uthealth Biomedical Informatics奖学金委员会选中,以获得享有声望的SBMI Dean卓越奖学金。Uthealth生物医学信息学学院(SBMI)院长卓越基金授予具有强大信息能力的SBMI学生,并被认为是信息学领域的潜在领导者。((05-14-2020)

恭喜,阿斯特丽德!作为SBMI的博士生,Astrid最近被任命为国家医学图书馆(NLM)生物医学信息学和数据科学培训计划的研究员。她的团契时间表是2020年7月1日至2021年6月30日,她的项目标题是“对多发性硬化症和血液癌之间有联系的药物靶标的药物重新定位策略的创新”。Zhonging教授Zhao博士和助理教授Assaf Gottlieb博士是她的奖学金导师。(04-17-2020)

恭喜,阿斯特丽德!作为第一年的研究生,阿斯特丽德已经接受了第一篇作者手稿,并在上个月在舒尔学院研讨会上作为口头演讲。现在,她获得了Schull Institute Summer计划奖学金。(04-03-2019)。

欢迎Lukas Simon博士加入Zhao博士的实验室和CPH,担任研究助理教授。beplay苹果手机能用吗卢卡斯(Lukas)获得了2016年贝勒医学院的结构和计算生物学和分子生物物理学博士学位,然后加入德国计算生物学研究所作为博士后。Lukas是单细胞RNA测序(SCRNA-SEQ)的专家。在过去的四个月中,他发表了三篇自然通讯论文,其中包括SCRNA-Seq方法,另一种用于衰老肺的地图集。(04-01-2019)

我们的文章“病毒探测者:通过下一代测序数据在宿主基因组中有效,准确检测的软件及其在宿主基因组中的整合位点”是最高的10%最多引用的PLOS One片段,其中有12,682个观看量和40个引用。(2017年6月30日)

BMC基因组学和BMC Systems Biology中发表了“ 2015年国际智能生物学与医学国际会议(ICIBM)(ICIBM)的补充”。可以在https://bmcsystbiol.biomedcentral.com/articles/supplements/volume-10-supplement-3)。(08-26-2016)

我们的SZGR已移至以下地址:https://bioinfo.uth.edu/szgr自从我们的实验室移居休斯敦的德克萨斯大学健康科学中心。数据库已更新。如果您有任何疑问,请与我们联系。(03.15.2016)

Feixiong Cheng博士被誉为2014/2015年度范德比尔特年度大奖赛奖的决赛入围者之一。恭喜!(04-23-2015)

我们的论文名为“基于蛋白质口袋的优先级方法在癌症中的癌症突变的功能后果”出现在基因组医学中是编辑的选择(10-17-2014)。

媒体报告:”布拉德福德的强大支持Bolsters黑色素瘤研究beplay苹果手机能用吗“appeared in the VUMC reporter (09-25-2014)

媒体报告:”VU研究揭示了精神疾病的共同途径“出现在VUMC记者(09-18-2014)中

Our paper entitled "VarWalker: personalized mutation network analysis of putative cancer genes from next-generation sequencing data" was recommended by网络图中的药物发现线索“出现在VUMC记者(08-01-2014)中

由卢森堡的国际/移动性前卫支持的访问博士萨布丽娜·弗里塔(Sabrina Fritah)到达了我们的实验室。欢迎!(07-28-2014)。

Santu的论文题为“可再生的组合regulatory networks elucidate novel oncogenic microRNAs in non-small cell lung cancer" was accepted by RNA. Congratulations, Santu!(05-01-2014).

我们欢迎两个新人:弗朗西斯科·阿祖耶(Francisco Azuaje)博士是卢森堡的客座科学家,而克里斯汀·帕尔齐奇(Christen Parzych)则为我们的新计划协调员。欢迎!(2014年5月1日)。

Our paper entitled "网络辅助对成瘾的潜在药物的预测“是AMIA TBI转化生物信息学杂志(2014年4月9日)中摘自的约30篇论文之一。

媒体报告:”网络工具速度肺动脉高压发现“ VUMC记者(03-05-2014)

Artwork from "An evidence-based knowledgebase of pulmonary arterial hypertension to identify genes and pathways relevant to pathogenesis" in分子生物系统被选为分子生物系统第4期(2014)的封面。(2014年2月29日)

我们最近的论文题为“基于证据的肺动脉高压知识基础,以鉴定与发病机理相关的基因和途径”分子生物系统推荐范德比尔特医学院在NIH资金中进入前十名(01-23-2014)

Wei Jiang博士加入了我们的实验室博士后研究员。欢迎!(01-16-2014)

Zhao博士在IEEE BIBM 2013会议上发表了一场邀请的演讲。谈话标题:“一种个性化突变网络方法,用于从下一代测序数据中检测假定的癌症基因”(12-20-2013)

PLOS计算生物学接受了Jia博士的手稿,标题为“ Varwalker:来自下一代测序数据的假定癌症基因的个性化突变网络分析”。恭喜!(2013年12月17日)

“卵巢癌中的分子电路” - 我们的卵巢癌调节网络纸突显了

VUMC记者强调了我们基于途径的牙齿龋齿GWAS分析的工作。(09-30-2013)

Zhao博士在佐治亚大学生物信息学研究所(08-23-2013)举行了一个题为“个人基因组学和个性化医学:当前的方法和挑战”的研讨会演讲。

我们在基因组研究中发表的工作被强调为beplay苹果手机能用吗9月刊的封面故事并在

CHGR助理教授Tony Capra博士访问了我们的实验室,并发表了他的演讲“整合基因组规模数据以预测人类特异性非编码突变的效果”(03-20-2013)

DRS的“下一代测序的工具和应用程序”研讨会。Zhongming Zhao,Peilin Jia,Huy Vuong和Qingguo Wang在范德比尔特医疗中心(03-20-2013)举行

约翰·霍普金斯大学生物信息学副教授江·齐安(Jiang Qian)博士访问了我们,并发表了他的演讲“基因调节和信号网络的全球分析”(03-13-2013)

华盛顿大学医学院基因组科学副教授Jay Shendure博士在范德比尔特(03-12-2013)发表了他的演讲“下一代人类遗传学”。

Zhao博士是NSF EPSCOR生物信息学研讨会(03-05-2013)的受邀发言人

Xingyi Guo博士加入我们的实验室,担任研究助理教授。beplay苹果手机能用吗欢迎!(03-01-2013)

克里斯塔尔·托索(Krystal Tsosie)女士加入了我们的实验室进行轮换项目。欢迎!(02-28-2013)

国际智能生物学与医学会议(ICIBM 2013)将于2013年8月11日至13日在美国纳什维尔举行。单击此处查看论文(01-03-13)

Zhao博士是第23届国际基因组信息学会议的邀请发言人(12-14-12)

Zhao博士是第一届国际转化生物医学信息学会议(ICTBI 2012)(12-10-12)的全体议长(12-10-12)

Zhao博士是弗吉尼亚联邦大学生物统计学研讨会系列系列(11-30-12)的邀请发言人

Zhao博士是美国人类遗传学学会第62届年会(11-08-12)的平台演讲者(11-08-12)

Zhao博士是弗吉尼亚理工学院电气与计算机工程部布拉德利电气与计算机工程部的邀请发言人(10-26-12)

Zhao博士是纽约大学Langone Medical Center(10-25-12)的健康信息学和生物信息学中心的邀请发言人

Zhao博士是布卢明顿印第安纳大学信息学和计算学院的邀请发言人(10-16-12)

Dr. Zhao was an invited speaker in Center for Computational Biology & Bioinformatics, Indiana University School of Medicine (10-15-12)

Zhao博士是下一代测序数据挖掘工作室的主题演讲者,IEEE BIBM'12(10-04-12)

蒂莫西·奥布莱恩(Timothy O'Brien)先生加入我们的实验室,担任NIH旋转项目的NIH冠军研究员。欢迎!(10-2012)

Soochow University的Junfeng Jiang先生加入了我们的实验室,成为一名访问博士生。欢迎!(09-01-2012)

密歇根大学的Huy Vuong博士以NLH/NLM博士后研究员的身份加入了我们的实验室。欢迎!(09-01-2012)

达尔文·富(Darwin Fu)先生加入了我们的实验室,担任NIH的旋转项目。欢迎!(2012年9月9日)

来自斯坦福大学的Ramkrishna Mitra博士加入了我们的实验室博士后研究员。欢迎!(08-16-2012)

Dr. Zhao was an invited speaker in Lieber Institute for Brain Development, John Hopkins University (08-14-12)

网络方法产生胶质母细胞瘤线索“-Our work recently published inPLOS计算生物学被包括在内MNT(今天的医学新闻),,,,MedicalXpress,,,,Eurekalert AAAS癌症研究新闻beplay苹果手机能用吗,,,,VUMC记者,,,,F1000建议,其他。

我们最近基于基因组测序的论文,标题为“黑色素瘤中的BRAF L597突变与对MEK抑制剂的敏感性有关”,在癌症发现中发表了。期刊封面页,,,,1000个基因组项目会议。(7-13-12)

Zhao博士最近接受了GenomeWeb的采访,并在Genome Technology Magazine的封面故事中介绍了有关Genomics In the Clinic。(7-2-12)

我们的手稿名为“下一代测序在人类基因融合检测中的应用:计算工具,特征和观点”被生物信息学的简报所接受。恭喜,青道。(6-29-12)

The Topical Issue on Systems Biology that Dr. Zhao and colleagues edited was published in Chem & Biodiversity. Click here for details. (6-14-2012)

Zhao博士是生物精神病学会的邀请发言人,“基因组学,表观基因组学和遗传学的整合,以对精神病的生物学理解”,第67届年度科学公约和计划,美国宾夕法尼亚州费城,美国宾夕法尼亚州(5-5-5-5-2012)

Dr. Bing Wang accepted a full professor faculty position in China. Congrats! (04-30-12)

国际智能生物学与医学会议(2012年)于2012年4月22日至24日在范德比尔特成功举行。链接在这里。

我们的NGS目录数据库文章被人类突变接受。恭喜Junfeng领导了这项努力!(03-09-2012)

Our recent work published in J Med Genetics (Medlinx网站((12-27-2011)

我们的轮换学生丹尼尔·普特曼(Daniel Putman)先生根据他在我们实验室中的旋转工作,2011年10月22日至26日在2011年10月22日至26日在我们的实验室中赢得了最佳学生纸奖比赛的二等奖。恭喜!(10-23-2011)

Zhao博士是田纳西大学健康科学中心(11-03-2011)的受邀发言人

Zhao博士是内布拉斯加州大学医学中心(10-19-2011)的受邀发言人

Zhao博士是2011年Informatics Day,密苏里大学,密苏里州哥伦比亚大学,2011年10月17日,2011年10月17日

Zhao博士是第Xixth世界精神遗传学大会(WCPG)的邀请发言人。(9-12-2011)。

根据我们的前轮换学生丹·普特曼(Dan Putman)先生的工作,该论文被选为Amia学生最佳纸质比赛的决赛入围者之一。DBMI培训计划主任辛迪·加德(Cindy Gadd)博士补充说:“您的第一个研究旋转项目成为Amia学生纸决赛入围者 - 这是第一个!恭喜!”(beplay苹果手机能用吗9-8-2011)。

Ms. Alex Fish joined our lab as an Vanderbilt IGP rotation student. Welcome! (9-7-2011)

考虑到我们的主要研究转向系统和转化医学,我们将实验室重beplay苹果手机能用吗命名为生物信息学和系统医学实验室(BSML)。(9-2-2011)。

Zhao博士是俄亥俄州立大学生物医学信息学系的邀请发言人。(8-30-2011)。

Zhao博士是辛辛那提儿童医院医疗中心的邀请发言人。(8-26-2011)。

路易斯维尔大学的Bing Wang博士加入了我们的实验室博士后研究员。欢迎!(8-1-2011)

Zhao博士是国际癌症系统生物学研讨会的邀请发言人(ICSB 2011)。(7-3-2011)。

由我们的轮换学生准备的手稿丹·普特曼先生被阿米亚接受。恭喜!(6-20-2011)。

Zhao博士是弗吉尼亚州里士满系统生物学第四次峰会(6-17-2011)的发言人。

保罗·哈特(Paul Hart)先生加入我们的实验室,担任NIH/NLM暑期实习生。欢迎!(6-15-2011)

Jingchun Sun博士被提升为DBMI的研究教练。beplay苹果手机能用吗恭喜!庆祝聚会将于6月23日(2011年5月16日)举行

密苏里大学的旺瓜博士加入了我们的实验室博士后研究员。欢迎!(5-16-2011)

Peilin Jia博士是2010/2011年度范德比尔特年度最佳奖项的决赛入围者之一。恭喜!(4-26-2011)

Siyuan Zheng博士在第10届年度UT-ERNL-KBRIN生物信息学峰会(4/2/2011)中对HCC数据的网络分析进行了口头介绍。

Zhao博士是德克萨斯大学圣安东尼奥分校的希腊儿童癌症研究所的邀请发言人(3-7-2011)。beplay苹果手机能用吗

Zhao博士是美国国家环境健康科学研究所生物统计学分公司的邀请发言人(2-15-2011)。

Our 2010 summer intern Mr. Jian Tian was a co-author of a recent paper appeared in IJCBDD. Congratulations! (1-20-2011).

Dr. Peilin Jia, postdoctoral fellow, in our lab was the recipient of the 2011 NARSAD Young Investigator Award Congratulations! (12-30-2010).

博士后研究员Jingchun Sun博士在我们的实验室中获得了2011年Narsad年轻调查员奖的获得者!(12-30-2010)。

Many needles in genetic haystack“ - 我们最近在生物信息学上发表的工作包括在VUMC记者(12-16-2010)中。

我们最近出版的合作工作癌细胞被记录在中请参阅此处的链接。(2010年11月26日)

恭喜BRC的生物信息学实习生Ketaki在芝加哥伊利诺伊大学获得生物信息学核心工作。她的告别于周三(2010年11月11日)举行。

哈佛大学的John Quackenbush教授访问了VICC,并介绍了他的作品“网络和国家空间模型:科学和科幻小说的细胞命运预测方法”(11-12-2010)。

Zhao博士是约翰·霍普金斯大学医学院(11-02-2010)的Wilmer Eye Institute的邀请演讲者和视觉神经科学培训计划(VNTP)。

Zhao博士被选为2010年尼克·诺根奖(Nick Norgan Award),作为2009年(10-14-2010)期间发表的《人类生物学》中发表的最佳论文的首席作者。

Zhao博士是佐治亚州立大学计算机科学系的邀请发言人(10-22-2010)。

癌症2.0- 利用癌症研究与护理的计算能力(06-17-2010)beplay苹果手机能用吗

精神分裂症数据:一站式购物(06-25-2010)

•现在可用的位置:

BSBL中的生物信息学工程师I(关闭)

BSBL的生物信息学的博士后研究员

• We welcome graduate and undergraduate students to join our lab.

历史

我们的新BRC(生物信息学资源中心)办公室套件进行了翻新,现在已经实现了。(2010年7月19日)

我们欢迎四个新成员(Chunling Wan -Postdoc研究员; Jian Tian -NIH/NLM暑期实习生; Satishkumar Ganakammal -Bioinformatics工程师I;和Ketaki Bhide-生物信息技术工程师实习生)。欢迎午餐会议将于2010年6月11日在BRC室(2010年6月8日)举行。

Jingchun Sun博士被提名为年度范德比尔特博士后。恭喜!(2010年4月20日)

两名成员(Peilin Jia和Zhongming Zhao)在UT-ERNL-KBRIN生物信息学峰会(3/20/2010)介绍了他们的作品

我们的合作者站在癌症(SU2C)赠款中是为了支持下一代癌症研究人员的资助。beplay苹果手机能用吗VUMC记者-Aliquots(2009年11月20日)

“如果老鼠可以说话”。自然记者Erika Check Hayden于2009年10月22日强调了我们的合作者的作品,出现在Nature Blog中

Dedeepya Vaka女士加入了VMSR的生物信息学小组。欢迎!(2009年11月1日)

Anyuan Guo博士接受了华Zhong科学技术大学的完整教授职位。恭喜!(10/1/09)

Dr. Siyuan Zheng from Shanghai Institutes for Biological Sciences, Chinese Academy of Science joined our lab as a postdoc fellow. Welcome! (9/25/09)

Dr. Hung-Chung (Joe) Huang from Department of Systems Biology and Translational Medicine, Texas A&M Health Science Center joined the Bioinformatics Group in VMSR as a senior bioinformatician. Welcome! (10/1/09)

•现在可用以下数据库:
- 与乙醇相关的基因资源:ERGR
- 精神分裂症基因资源:SZGR
- 最近出版物:
Sun J, Wan C, Jia P, Fanous AH, Kendler KS, Riley BP, Zhao Z (2010) Application of systems biology approach identifies and validates GRB2 as a risk gene for schizophrenia in the Irish Case Control Study of Schizophrenia (ICCSS) sample

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