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生物医学信息学


SBMI博客文章


成为信息家需要什么?


2015年7月1日,星期三
写的托德·约翰逊(Todd Johnson),博士

信息家信息学是信息科学。知情者确定,定义和解决信息问题。确定一种药物是否比另一种药物更好地治疗某种类型的乳腺癌是一个临床研究问题。beplay苹果手机能用吗开发一种方法来自动鉴定出可能从已发表文献中治疗乳腺癌的药物是一个信息问题。

信息问题的另一个例子是从患者的电子病历中自动创建有意义的患者概述。哪些信息构成了一个很好的概述?“好”如何取决于看概述的人的目标?如何从图表中的自由文本中提取有意义的信息?您如何最好地提供信息,以便一个人可以快速掌握信息?

假设您创建和测试移动应用程序,以帮助糖尿病患者跟踪餐食,运动,胰岛素,葡萄糖和HBA1C,然后研究其是否改善葡萄糖控制。这不是信息问题或解决方案,因为它无法识别或解决信息问题。仅仅因为它使用移动应用程序(IT)来跟踪数据,但并不能使其成为信息解决方案 - 信息既不是计算机科学,也不是IT,尽管它经常将两者都用作工具。在这一领域有什么好的信息问题?一种信息学方法是研究糖尿病患者需要采取的各种操作以及他们需要确定要采取哪种操作的信息,然后创建一个可视化,使他们可以快速“看到”他们需要做的事情。

那么,您需要做什么知情者?至少,一组技能称为计算思维,或简称CT。Google很好地打破了CT分为四个基本子技能:

尽管包括算法设计在内的CT不是编程或数学,但目前学习和演示CT技能的最佳方法是学习开发和编程算法并创建计算和数学模型。

您可以通过多种方法获得这些技能。对于计算思维,我建议:

由于具有实时反馈的交互式内部代码编辑器,因此Udacity类非常好。您应该能够免费注册这些课程的免费或低成本版本。

数学模型的一个好地方是:

如果您只有一对夫妇的介绍,请首先介绍CS和模型思维。但是继续学习。这些是知情人士的基本技能,作为一名知情者,您将始终需要学习更多的技术技能,尤其是技术技能。您拥有的技术技能越多,您就越有效。

有些人可能会告诉您,许多顶级知情者从未编程或开发数学模型。的确如此,但是看看他们的工作,您将看到CT的所有元素。学习编程和应用数学模型只是发展CT技能的途径。

生物医学信息学课程常常回避教学或需要技术技能,因为他们担心来自不同,非技术背景的学生将无法学习这些技能。这是无稽之谈。首先,CT技能对于进行信息学是绝对必要的。其次,就像任何一组技能一样,CT技能都可以教授和学习。因此,如果您正在寻找一项信息学计划,请务必选择一个教授或需要这些技能的信息。如果您不在一个计划中,请确保自己获得它们。没有他们,您根本就不能成为信息家。

托德·约翰逊博士

托德·约翰逊(Todd R. Johnson)博士是Uthealth生物医学信息学(SBMI)的生物医学信息学教授。约翰逊(Johnson)在SBMI上的努力侧重于在临床环境中应用信息学,包括质量和安全仪表板,视觉分析,临床研究信息学和大数据,用于医疗保健。beplay苹果手机能用吗他的研究beplay苹果手机能用吗使用认知科学,计算机科学和人为因素工程来解决生物医学信息学问题。

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