W. Jim Zheng,博士,硕士,2013年加入uthealhealth生物医学信息学学院,担任副教授和计算生物医学中心副主任。郑博士在德克萨斯大学达拉斯分校获得计算机科学硕士学位,在德克萨斯大学西南分校获得博士学位后,他发现了一种新的酶机制[1],他的大部分职业生涯都是在工业和学术背景下的生物信息学研究。beplay苹果手机能用吗在他的早期职业生涯中,郑博士在工业领域从事生物信息学研究和开发项目,涉及功能基因组学和数据管理、基因组注释、比较beplay苹果手机能用吗基因组学和疾病相关基因组区域的基因发现。他还开发了商业基因组数据库和生物信息学软件。
郑博士的研究兴趣集中在如beplay苹果手机能用吗何整合、建模、可视化和挖掘真核基因组信息用于转化医学。他还在探索知识表示的新方法。郑博士和他的同事开发了Genome3D,这是第一个以三维[2]整合和可视化真核生物基因组的模型视图框架。他的团队还开发了本体指纹的概念,这是第一个通过挖掘生物医学文献计算开发的基因本体术语嵌入[3,4]。郑博士及其同事正在开发用于生物医学研究和疾病风险预测的各种深度学习模型。beplay苹果手机能用吗他在JAMA[5]上的一篇文章中分享了他对数据科学、信息学和人工智能的看法。采用数据驱动的方法,郑博士的团队和他的同事最近发现,在病人来源的异种移植(PDX)中广泛存在鼠病毒基因组序列。这一发现引起了对这一重要的抗癌药物开发平台质量控制的严重关注,并为完善药物开发流程提供了一些建议。
郑博士还建立并领导了癌症研究数据科学和信息学核心(beplay苹果手机能用吗DSICCR) -拥有专业知识的尖端数据科学资源,包括高通量基因组数据分析、系统生物学、电子健康记录挖掘和临床数据仓库开发。他还指导生物信息学与高性能计算服务中心-临床和转化科学中心的一部分,由NIH CTSA奖资助。
郑博士目前的转译研究包括开发新的数据挖掘方法,从生物医学文献中提取信beplay苹果手机能用吗息,用于癌症、阿尔茨海默病和其他慢性疾病的新治疗策略。郑博士是两家生物信息学期刊的编委会成员,他的研究目前得到了NIH和the Cancer Prevention and research Institute obeplay苹果手机能用吗f Texas的支持。
“在生物医学研究中,从数据生成到数据分析的范式转变为信息学家创造了大量的机会,”郑说。beplay苹果手机能用吗“通过信息学研究,将生物医学发现转化为临床实践成为可能。”beplay苹果手机能用吗
郑博士的全部出版记录可于以下网址查阅:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/18EP7Fevc6fkn/bibliography/48626907/public/?sort=date&direction=ascending
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