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SBMI标志

Lichong Cui,PHD

助理教授

崔利从,博士,2019年1月加入犹他大学生物医学信息学院(SBMI),终身助教。在此之前,她是计算机科学系的终身助理教授和肯塔基大学生物医学信息学研究所的成员。

崔博士的主要研究目标是开发算法和软件beplay苹果手机能用吗工具,以解决生物医学中的数据科学问题。Cui博士的研究兴趣beplay苹果手机能用吗包括本体和术语,大数据分析,大规模数据集成和管理,信息提取和信息检索。崔博士发表了70多个同行评审研究论文,并作为由NSF和NIH资助的许多补助金的主要调查员beplay苹果手机能用吗。

作为一名训练有素的生物医学信息学计算机科学家,崔博士在算法和计算方法方面有很强的基础。例如,她设计并开发了用于分析生物医学数据的可伸缩算法,包括从临床叙述中提取癫痫表型,用于患者队列识别,计算非格子子图,以及在SNOMED CT中检测关系逆转,在非格点子图中挖掘词汇模式,以检测SNOMED CT、Gene Ontology和NCI词库中缺失的层次关系和概念,在统一医学语言系统中进行跨本体层次关系检查,并从国家睡眠研究资源中挖掘不同的临床数据集。beplay苹果手机能用吗同时,崔博士在应用信息学,特别是基于web的软件开发生命周期方面有着丰富的经验。例如,她为国家睡眠研究资源设计、开发和部署了一个跨队列查询系统和一个癫痫研究中猝死的数据集成系统。beplay苹果手机能用吗崔博士在多学科团队环境下与睡眠研究人员、癫痫研究人员、癌症研究人员和其他信息学家进行合作工作。beplay苹果手机能用吗

“作为生物医学研究界产生的越来越大的数字数据,本体和术语已被广泛用于协调生物医学数据的编码,管理,交流和分享。beplay苹果手机能用吗My research interest spans from the theoretical and computational aspects for analyzing biomedical ontologies (e.g., ontology quality assurance) to the application of ontologies to solve large-scale data science problems in biomedicine (e.g., information extraction and retrieval, data integration and management, and data mining). I am passionate at conducting data science related research in collaboration with biomedical and clinical domain experts.”

联系

lichong.cui@ut.tmc.edu.
电话:713-500-3791.
传真:713-500-3929.

工作人员支持

Leticia Flores.
电话:713-500-3912


教育

  • 博士,计算机科学,案例西部储备大学,2014
  • 陕西师范大学MS,纯数学,2008
  • BS,信息和计算科学,陕西师范大学,2005

专业领域

  • 本体和术语
  • 大数据分析
  • 神经素信息学
  • 健康信息提取和检索

选定的出版物

[1]崔L,Bodenreider o,Shi J,张GQ,基于非格子子图概念的词汇特征审核SnoMed CT层次关系。中国生物医学信息学杂志,2018; 78:177-184。

[2]张GQ,崔L,Mueller R,Tao S,Kim M,Rueschman M,Mariani S,Mobley D,Redline S.国家睡眠研究资源:朝向睡眠数据共享。beplay苹果手机能用吗美国医疗信息学协会杂志,2018; 25(10):1351-1358。

[3]崔L,曾经,金米,穆勒河,哈坎萨基·呃,Zhangly,张GQ。X搜索:用于国家睡眠研究资源的交叉队探索的开放式接口界面。beplay苹果手机能用吗BMC医疗信息和决策,2018; 18:99。

[4]郑F,崔L。基于深度学习的SNOMED CT概念名称预测方法研究。2018年IEEE生物信息学与生物医学国际会议,pp. 808-813。

[5] abeysinghe r,qu x,崔L。基于结构同构和概念标签的结构同构和语义相似性识别基因本体中类似的非格子子图。AMIA年度SEMP PROC 2018,第1186-1195页。[学生论文奖决赛选手]。

[6]崔L,朱镕基,陶某,案例JT,Bodenreider O,张GQ。用于检测Snomed CT中缺失的层次关系和概念的挖掘非格子子图。美国医学信息学协会杂志,2017年; 24(4):788-798。

[7] Abeysinghe R,Brooks Ma,Talbert J,崔L。采矿结构词汇模式对NCI词库的质量保证。AMIA年度SEMP PROC 2017,第364-373页。

[8]崔L,陶氏,张GQ。生物医学本体学用大数据方法质量保证。来自数据的知识发现的ACM交易,2016; 10(4):41。

[9]崔L,黄玉,陶某,拉特多斯,张GQ。ODACCI:在Sudep Research中的Ninds Center中多路临床研究数据集成的本体论 - 引导数据策策。beplay苹果手机能用吗AMIA年度SEMP PROC 2016,第441-450页。

[10]崔L。合作:本体质量保证的跨本体层次关系检查。AMIA年度SEMP PROC 2015,第456-465页。

[11]崔L。Sahoo Ss,Lhatoo Sd,Garg G,Rai P,Bozorgi A,张GQ。复杂的癫痫表型提取叙事临床排放摘要。中国生物医学信息学报,2014;51:272-279。

[12]崔L。卡特河,张gq。用于消费者健康信息的新型联合探索导航界面的评价:众群比较研究。医学互联网研究杂志,2014; 16(2):E45。beplay苹果手机能用吗

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