教育

博士后研究员
加利福尼亚大学,圣地亚哥,2008年
博士后研究员
苏黎世大学,瑞士,2005年
博士
苏黎世大学,瑞士,2003年

beplay苹果手机能用吗研究信息

我们使用计算机模拟来研究细胞信号成分,界面相互作用和变构的组织,以帮助开发未解决的健康挑战的治疗方法。我们的特别重点是调节各种细胞信号通路的脂质改性酶的RAS家族,其故障导致多种形式的癌症。迫切需要持续的努力找到通过缺陷的RA消除信号传导的药物。为了促进这一努力,我们使用多尺度模拟以及协作细胞生物学和生物物理实验研究了RAS的RAS。我们特别感兴趣地了解RAS和相关G蛋白在膜表面上的动态和横向分布如何影响其与其他蛋白质功能相互作用的能力。该组的其他兴趣包括对特定药物和磷脂之间的瞬态信号复合物进行建模和相互作用。

我们实验室中的一个教程将提供有关生物分子模拟中现代技术的经验,用于研究分子复合物组装和功能的热力学原理。

Gorfenewsummary群集

出版物

出版信息

  • Zhenlong Li和Gorfe aa。(2014)。调节小型两域脂质囊泡的linactants。J物理化学b,18(30):9028-9036。
  • Hualin Li和Gorfe aa。(2014)。通过表面结合的蛋白聚集体进行膜重塑:粗粒分子动力学模拟的见解。J物理化学LTTR,5(8):1457-1462。
  • Prakash P和Gorfe aa。(2014)。GTPase RAS的酶活性和构象动力学的模拟研究概述。分子模拟,40(10-11):839-847。
  • Hocker HJ,Maharaj N和Gorfe aa。(2014)。libsa - 确定配体结合偏好对受体集合上的变构位点的方法。J化学信息和建模,24; 54(2):530-538。
  • Ramaswamy SS,MacLean DM,Gorfeaa,Jayaraman V.(2013)。pH诱导的酸性离子通道中的构象变化。J Biol Chem。,288,35896-35903。
  • Prakash P,Gorfe aa。(2013)。来自溶液和膜中RAS蛋白的计算机模拟的经验教训。bba-gen subj。1830,5211-5218。
  • 李Z,Gorfe aa。(2013)。由于脂质修饰的RAS肽的不对称插入,两域脂质双层的变形。软物质。,9,11249-11256。
  • Prakash P,Gorfe aa。(2013)。磷脂酰胆碱用胆汁盐衰减非甾体类抗炎药的聚集。生物化学。52,7461–7469。
  • 品牌CS,Hocker HJ,Gorfe aa,Cavasotto CN,Dessauer CW。(2013)。腺苷酸环化酶抑制剂的同工型选择性:已知和新颖化合物的表征。J Pharm Exp Therap。,347,265-275。
  • 李H,Gorfe aa。(2013)。双层中全长H-RAS蛋白的聚集:与马提尼力场的模拟。PLOS ONE。8,E71018。
  • Hocker HJ,Cho K-J,Chen C-YK,Rambahal N,Sagineedu SR,Shaari K,Stanslas J,Hancock JF,JF,Gorfe aa。(2013)。雄激素衍生物抑制鸟嘌呤核苷酸交换并消除致癌性RAS功能。Proc Natl Acad Sci U S A.,110,10201-10206。
  • Cho KJ,Park JH,Piggott AM,Salim AA,戈夫a,Parton RG,Capon RJ,Lacey E,Hancock JF。(2012)。星形孢菌素破坏磷酸 - 丁基丝氨酸的运输和误定位的RAS蛋白。J Biol Chem。,287,43573-43584。
  • Janosi L,Li Z,Hancock JF和Gorfe aa。(2012)。膜域中RAS纳米簇的组织,动力学和分离。Proc Natl Acad Sci。109,8097-8102。
  • 李Z和Gorfe aa。(2012)。是什么驱动膜结合RA的聚类?小GTPases。,3,244-247。
  • 李Z,Janosi L和Gorfe aa。(2012)。H-RAS肽纳米簇的形成和结构域分数:肽浓度和脂质组成的作用。J Am Chem Soc。,134,17278-1728。
  • Prakash P,Sayyed-Ahmad A和Gorfe aa。(2012)。保守水在Q61H K-RAS的构象转变中的作用。PLOS Comput Biol。,8,E1002394。
  • Prakash P,Sayyed-Ahmad A,Zhou Y,Volk DE,Gorenstein DG,Dial EJ,Lichtenberger LM,Gorfe aa。(2012)。布洛芬,胆酸和二磷脂酰胆碱胶束的聚集行为。Biochim Biophysica Acta。1818:3040-3047。
  • Grant BJ,Lukman S,Hocker H,Sayyah J,Heller Brown J,McCammon JA,Gorfe aa。(2011)。RAS上的新型变构遗址以产生潜在客户。PLOS ONE,6,E25711。
  • Janosi L,和Gorfe aa。(2010)。模拟POPC和POPC/POPG双层:保守的填料和改变表面反应性。J化学理论计算。,16,3267-3273。
  • Janosi L,和Gorfe aa。(2010)。鞘氨醇碱基双键几何形状对于鞘磷脂双层的结构和热力学特性的重要性。Biophys j。,99,2957–2966。(特色文章)
  • Janosi L,和Gorfe aa。(2010)。KRAS的多阳离子和法尼化膜锚将带负电荷的磷脂分离。Biophys J.,99,3666-3674。
  • 周lu b-z,Gorfe aa。(2010)。蛋白质膜相互作用的连续机电模型。Phys Rev e。,82,41923-41928。
  • Sayyed-Ahmad A,Lichtenberger LM和Gorfe aa。(2010)。胆酸和十二烷基磷酸胆碱酸聚集体的结构和动力学。Langmuir,26,13407-13414。
  • Abankwa D,Gorfe aa,Inder K和Hancock JF。(2010)。RAS膜方向和纳米域定位会产生同工型多样性。PROC NAT’L AC SC USA。,107:1130-1135。
  • Gorfe aa。(2010)。RAS GTPases中变构和膜附着的机制:对抗癌药物发现的影响。Curr Med Chem。,17:1-9。
  • 授予B,Gorfe aa和McCammon JA。(2010)。蛋白质的大构象变化:信号传导和其他功能。Curr Opin struct Biol。,20:142-147。