模拟器对神经网络和动作电位(SNNAP)
SNNAP软件主界面。
SNNAP是快速开发的工具和单神经元和神经网络的模拟现实的模型。它包括离子电流的数学描述和胞内第二信使和离子。此外,您可以模拟电流在multicompartment模型的神经元通过描述电耦合方程。
SNNAP还包括胞内第二信使和离子的数学描述,模拟膜电流的调制和突触传递,增强或抑制。
SNNAP的其他优点包括:
- 用JAVA编写的,可以在几乎任何类型的计算机系统上运行。
- 图形用户界面
- 模拟常见的实验操作能力。
- 模块化组织的输入文件。
SNNAP发展支持了AFOSR格兰特f49620 - 93 - 1 - 0272,以及国家卫生研究院的基金R01-RR11626 P01-NS38310。
SNNAP概述
SNNAP设计作为一种工具的迅速发展,单一神经元的模拟现实的模型和小神经网络。单个神经元的电特性描述与Hodgkin-Huxley类型电压-时间和相关的离子电流。神经元之间的连接可以通过电或化学突触。化学突触连接能够表达一些形式的可塑性,如homo和heterosynaptic抑郁和便利化。
SNNAP还包括胞内第二信使和离子的数学描述。第二信使的合成可以由突触输入或外部应用发射器。离子的积累可以由任何指定的电压-时间和相关的离子电流(年代)。细胞内离子浓度和/或第二信使,反过来,可以链接到一个或更多的离子电导和/或导致化学突触传递机制。因此,SNNAP可以模拟调制,增强或抑制,膜电流和突触传递。
SNNAP也可以模拟电流multicompartment神经元模型通过描述电耦合方程。(具体细节SNNAP数学组件,看到Ziv,巴克斯特和伯恩(1994)神经网络和动作电位的模拟器:描述和应用程序。j . Neurophysiol。71: 294 - 308)
一些SNNAP的优点包括:
- 一个图形用户界面(GUI)。
指定一个神经元的内在属性的各个方面,网络的结构,并运行模拟的性质,如视觉显示并保存数据文件,可以通过编辑控制纳入SNNAP使用图形界面。因此,编程技能是很少或没有必要使用模拟器。 - 模拟常见实验操作的能力。
例如,SNNAP可以模拟外部电流注入到多个细胞,去除个人电导来模拟药理剂,调制的膜电流通过调节发射器和voltage-clamping细胞的应用。 - 模块化组织的输入文件。
所有方程及相关参数和常量传递SNNAP通过大量文件生成的图形编辑器。这些输入文件的层次组织允许创建一个库的模块描述神经网络的不同方面(如描述各种压敏电阻器的电导,神经元突触连接或调节操作),从而促进新神经元的创建或从现有网络元素和合作者之间的交换文件。