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个性化医学:信息学问题


2014年10月8日,星期三

数万美元:这就是不到十年前的序列基因组的成本。如今,费用约为5,000美元,预计将继续下降。

通过对个别患者的基因组分析,现在更加负担得起,并且针对临床试验测试的特定分子畸变的疗法在这里进行个性化医学。目前,仅在MD Anderson癌症中心(MDACC)就有超过800次正在进行的针对性治疗试验。

做出个性化医疗决策所需的信息所有希望为患者个性化治疗的从业者都面临着同样的问题:关于特定患者和可用疗法的信息太多了,目前必须手动管理所有这些疗法(见图1)。

尽管我们最终具有提供个性化癌症疗法的能力,但即使是专业临床医生也需要帮助解释基因组数据。生物医学文学的快速扩展的身体实在太多了。

在MDACC,个性化癌症治疗研究所(IPCT)促进了分子测试和个性化治疗选择。

要建议基于患者的分子特征进行治疗,需要许多步骤:基因组数据注释,文献综述,以确定“驱动”疾病过程的分子畸变,以及基因组谱和特定靶向疗法之间的关联。该信息用于最佳地匹配患者批准的药物和研究分子疗法的开放临床试验。

当前的手动筛选如此庞大的数据语料库效率低下,笨拙且不扩展。因此,它不能支持常规(“护理标准”)个性化疗法。

需要自动化(或至少半自动化的)信息学工具来为所有癌症患者个性化治疗。换句话说,个性化医学是信息学可以解决的挑战。

关于乳腺癌的出版物1970-2013这是乳腺癌的一个特殊问题。临床意义,可操作的信息正在不断发现(见图2),并以不断增长的速度发布。确定在临床上可行的知识,然后将其应用于个别患者的护理,即使是最勤奋的临床医生也需要帮助。

在SBMI和MDACC,我们正在开发工具,这些工具会自动挖掘生物医学文献,以鉴定可以给患有特定分子异常肿瘤的患者提供的药物。该信息由个性化的癌症治疗专家审查并在线发布(http://personalizedcancertherapy.org),以便所有受癌症影响的人都可以使用此信息。

这项工作得到了国家前进的转化科学中心(Grant UL1 TR000371),临床和转化科学中心,国家癌症研究所1U01 CA180964,Sheikh Khalifa Al Nahyan Ben Zayed Institute for Nynealized Cancer Therapy,Nellie B. Nellie B. Nellie B. Nellie B. Nellie B.康纳利乳腺癌研究主席基金,医学博士安德森癌症中beplay苹果手机能用吗心(支持拨款P30 CA016672)和癌症预防奖学金(国家癌症研究所Grant R25T CA57730)。

这只是SBMI通过协作合作伙伴关系和信息学在医疗保健中的应用而在医学上有所作为的另一种方式。

写的医学博士Elmer Bernstam,MSE
来自W. Jim Zheng,博士基金会Meric-Bernstam,医学博士

Elmer Bernstam博士的爆头

MSE医学博士Elmer Bernstam博士是研究副院长,也是Uthealth Biomedical Inbeplay苹果手机能用吗formatics的教授。他是美国医师学院和美国医学信息学学院的会员,并且在内科医学领域也得到了认证,并继续练习。他的研究beplay苹果手机能用吗兴趣是信息检索,消费者信息学和临床决策支持。

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