生物医学信息学

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数据库建设;数据管理

临床信息学主任:Elmer V. Bernstam,医学博士,MSE
翻译信息学联合主任(UT MDACC领导):基础Meric-Bernstam博士
生物信息学联合:Jeffrey Chang博士

生物资讯服务组主任:郑文进(Jim),博士Wenjin.J.Zheng@uth.tmc.edu-713-500-3641
联系人:Rifhat阿里-Rifhat.Ali@uth.tmc.edu-713-500-3926
主要网站:https://sbmi.uth.edu/uth-big/

目的

翻译研究需要将在一个语境中获beplay苹果手机能用吗得的知识应用到另一个语境中,从而将数据从一个语境转移到另一个语境。CCTS生物医学信息学部分的目标是通过改善沟通和整合不同的数据源(包括临床、实验室、监管和管理数据),实现临床和转化研究的转型。beplay苹果手机能用吗生物医学信息学部分在两个层面开展工作:机构个人

机构层面

组件在这一级的活动可概括为:

  • 开发研究临床数据仓库(CDbeplay苹果手机能用吗W),允许从多个来源和机构访问数据,包括开发流程和实施系统,以在CCTS的组成机构之间和uthehealth的6个组成学校之间传输数据外围beplay
  • 在uthealhealth中工作,促进数据管理的最佳实践,以允许数据集成和重用
  • 在国家一级与其他CTSA机构合作,制定支持生物医学研究的政策和方法beplay苹果手机能用吗
  • 推进生物医学信息学

个人层面

在这一级,构成部分与计划进行研究的调查人员协商,以协助他们满足信息学需要,包括:

  • 帮助研究人员遵循数据管理的“最佳实践”,包括:
    • 维护数据安全
    • 通过遵循提交给FDA的适当数据标准,按照NIH指南提供数据集,以协助遵守监管数据处理标准,等等。
    • 简化数据输入和管理流程
  • 设计和实现数据库
  • 组成和实现临床数据收集接口
  • 修改现有数据库以更有效地使用,包括从Excel转换到基于服务器的数据存储和分析
  • 帮助调查人员获取和使用电子访问UTHealth内外的现有资源

突出的工作

下面是团队工作的一个小概述。有关项目和服务的全面资料,请浏览https://sbmi.uth.edu/uth-big/

临床数据仓库

临床数据仓库(CDW)旨在为uthealhealth研究人员提供从不同系统获取临床数据的单一来源。这些数据已被用于多个研究任务的队列识别、比较有效性研究、自然语言处理(NLbeplay苹果手机能用吗P)以及人工智能(AI)和机器学习的各种应用。除研究外,该系统还用于质量改进beplay苹果手机能用吗项目。

Informatics的临床数据包括500多万名患者,每晚都会更新。与UT里约热内卢Grande Valley和UT Tyler合作的扩大CDW正在被用于推进Covid-19研究beplay苹果手机能用吗2019冠状病毒病全国协作组).

更多有关该数据的资料,请浏览https://big.uth.edu/bigarc/

搬运工服务

REDCap是一个安全的、基于网络的应用程序,用于建立和管理在线调查和纵向研究。使用REDCap的流线型流程快速开发项目,您可以通过上传数据字典文件或编程API,使用拖放在线设计器创建和设计项目。信息学团队为开发REDCap表格和个性化的REDCap培训提供支持。

有关REDCap服务的更多信息,请浏览https://sbmi.uth.edu/uth-big/services/redcap.htm

联系信息

使用cru的研究人员可以在iRIS/CCTS申请中请求生物信息学帮助。

其他调查人员可以联系riffat Ali (Rifhat.Ali@uth.tmc.edu)来讨论选择。

欲了解更多团队成员的信息,请访问:https://sbmi.uth.edu/uth-big/team/

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