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COHRI多嘴多舌的人

目的

口腔健康相关信息联盟的目的是建立一个口腔健康数据存储库,可以接受和整合来自不同牙科数据源的数据,并允许终端用户探索和提取信息,以支持他们的特定研究或决策需求。beplay苹果手机能用吗

我们正在与德克萨斯大学、加州大学旧金山分校、哈佛大学和塔夫茨大学合作,创建一个联合数据仓库,其中包含来自每个机构的牙科数据。为了支持Muhammad Walji博士的G08拨款,BIG团队正在努力创建一组脚本,这些脚本将从Axium实例(在附属站点上运行)中提取数据,并将其转换为通用格式。脚本将分发到参与机构,成员将执行脚本,并将提取的数据发送到UT,由BIG团队加载到合并的COHRI i2b2实例中,允许跨机构查询数据。

该项目的子组件将包括用于数据提取、传输和加载的可重复过程,以及用于验证和授权用户访问COHRI i2b2实例的过程。这两个过程将被记录并分发给协会成员。

最后,将向COHRI成员提供一个前端网站,允许参与机构的教师使用Shibboleth登录,一旦获得Walji博士的访问权限,就可以支持联合身份验证。它允许用户使用本地机构用户标识和密码对应用程序进行身份验证,并查询数据存储库。

它是如何工作的

UT Health创建了一组脚本从Axium数据库中提取数据。这些脚本创建的csv文件对应于i2b2表、观察事实表和患者维度表。我们已经将这些脚本分发给我们的四个合作机构,与他们的生产Axium数据库进行对比,提取人口统计数据、医疗和牙科历史表格、程序、提供商、诊断、牙病图和周期图表数据。一旦提取完成,机构将把数据发送给UT Health,我们将把数据导入我们的i2b2 COHRI数据仓库。此外,如果机构已经拥有i2b2基础设施,则可以将这些文件加载到其本地的i2b2数据仓库中,使它们能够通过i2b2访问自己的数据。

我们将努力将各个参与站点的各种术语映射到将成为COHRI术语的地方。这将是一个将术语映射到一起的手动和半自动化过程。除了映射任务之外,我们还将向i2b2数据提取脚本的Axium中添加额外的数据元素。最终,我们计划将参与机构的团体扩大到整个COHRI联盟。

参与网站

  • 位于休斯顿的德克萨斯大学健康科学中心
  • 加州大学旧金山分校
  • 塔夫茨大学
  • 哈佛大学

支持赠款

  • COHRI G08格兰特
  • CTSA目前格兰特
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