全基因组关联研究

研究ID ＃SNP ＃基因 层 参考 里面 更新
简历：Gwascat 560 486 层1 NHGRI-EBI GWAS目录 SZGR 2.0页 2016年5月18日
CV：GWASDB 560 2130 层1 gwasdb SZGR 2.0页 2016年5月4日
简历：PGC128 128 148 层1 精神病基因组学联盟（PGC） SZGR 2.0页 2016年6月1日
简历：Phewas 128 148 层1 Phewas SZGR 2.0页 2016年6月1日
简历：RIPKE_2013 128 27 层1 PubMed 2016年6月1日
简历：PGCNP 128 27 2级 精神病基因组学联盟（PGC） PubMed 2016年6月1日

Venn图比较了五层1 SNP中的SNP。

无法使用

Venn图比较了映射到50kb内的1级SNP的基因。

无法使用


从头突变

研究ID 第一作者 年 杂志 样本量 平台 音序器 PMID
DNM：Guipponi_2014 Guipponi 2014 PLOS ONE 53 Agilent SuneSelect人类所有外显子套件 hiseq 25420024
DNM：Girard_2011 吉拉德 2011 自然遗传学 623 Agilent SuneSelect人类所有外显子套件 hiseq 21743468
DNM：Takata_2014 高田A。 2014 神经元 231案例和34个控制三重奏 Agilent Sureselect V2（n = 85三重奏），nimblegen seqcap ez v2（n = 180三个） hiseq 24853937
DNM：McCarthy_2014 麦卡锡 2014 分子精神病学 57 nimblegen seqcap ez人类外显库v2.0探针 hiseq（101 bp pe读取） 24776741
DNM：Fromer_2014 fromer 2014 自然 617 Agilent SureSelect人类全部Exon v.2，Nimblegen Seqcap EZ Exome库v2.0，Agilent Sureselect人类全部EXON 50MB hiseq（76 bp，101 bp，76 bp pe读取） 24463507
DNM：Gulsuner_2013 古尔森 2013 细胞 105 nimblegen seqcap ez人类外来图书馆v2.0 hiseq（101 bp pe读取） 23911319
DNM：XU_2012 XU 2012 自然遗传学 231 Agilent Sureselect V2（n = 85三重奏），nimblegen seqcap ez v2（n = 180三个） hiseq 23042115
DNM：XU_2011 XU 2011 自然遗传学 53 Agilent SuneSelect人类所有外显子目标富集系统 hiseq（50 bp pe读取） 21822266
DNM：Awadalla_2010 阿瓦达拉 2010年 ajhg ASD和SCZ病例（n = 285）和285个对照 目标测序 401突触表达基因 20797689
脚注：DNM：XU_2011中的数据已包含在DNM：XU_2012中。

差异表达的基因

研究ID 平台 描述 ＃degs 组织 在szgr2中 参考
DEG：Zhao_2015 RNA测序 35个精神分裂症和35个对照 105个基因 脑 包括 25113377
DEG：Sanders_2014 Illumina HT12V4 413个精神分裂症和446个对照 95个成绩单 淋巴母细胞系 包括 23904455

差异甲基化基因

研究ID 平台 ＃cpgs 描述 ＃DMGS 组织 在szgr2中 参考
DMG：Montano_2016 Illumina HumanMethylation450 Beadchip 456,513 CPG 689个精神分裂症和645个对照 172记录 包括 27074206
DMG：Wockner_2014 Illumina HumanMethylation450 Beadchip 485,000 CPG 24个精神分裂症和24个对照 4641 血液 包括 26809779
DMG：Nishioka_2013 Illumina Infinium hommethylation27 Beadchip 27,578 CPG 18名日本Fesz患者（11名男性和7名女性）；15个日本年龄匹配的健康对照（10名男性和5名女性） 603 血液 包括 23235336
DMG：JAFFE_2016 Illumina HumanMethylation450 Beadchip 485,000 CPG 108个精神分裂症和136个对照 2104 DLPFC 包括 26619358
DMG：Vaneijk_2014 Illumina Infinium 27K人DNA甲基化Beadchip V1.2 27,000 CPG 260名SZ患者和250例未受影响的对照 血液 包括 25424713

精神分裂症中的拷贝数变化（CNV）基因座

轨迹 学习 参考 复制 ＃基因
1q21.1 del CNV：Levinson_2011 21285140 是的 35
CNV：REES_2014 24311552
2P16.3 CNV：Levinson_2011 21285140 是的 1
CNV：REES_2014 24311552
3Q29 CNV：Levinson_2011 21285140 是的 21
CNV：REES_2014 24311552
7q11.23 CNV：Sanders_2011 21658581 是的 26
CNV：REES_2014 24311552
7q36.3 CNV：Levinson_2011 21285140 是的 1
CNV：REES_2014 24311552
15Q11.2 CNV：REES_2014 24311552 不 14
AS/PWS DUP CNV：REES_2014 24311552 不 1
15Q13.3 DEL CNV：Levinson_2011 21285140 是的 16
CNV：REES_2014 24311552
16p13.11 dup CNV：REES_2014 21285140 不 9
16p11.2 dup CNV：Levinson_2011 21285140 是的 27
CNV：REES_2014 24311552
17q12 del CNV：Levinson_2011 21285140 是的 17
CNV：REES_2014 24311552
22Q11.21 DEL CNV：Levinson_2011 21285140 是的 49
CNV：REES_2014 24311552