全基因组关联研究
从五个独立资源中收集了一组SNP:GWAS目录(CV:GWASCAT),GWASDB,PHEWAS,PGC2和一项多阶段GWA研究。这些SNP具有与精神分裂症相关的有力证据,在大多数情况下都达到了全基因组的意义。如果需要,将原始记录重新映射到人类参考基因组HG19。然后使用工具Wannovar系统地对SNP进行系统注释。原始记录以与最初获得的方式显示在SNP页面和基因页面中。
从PGC2摘要结果收集了第2层集的SNP,名义p值<0.05。可搜索2级SNP,但在浏览页面中未列出,因为数字太大。
研究ID | #SNP | #基因 | 层 | 参考 | 里面 | |
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简历:Gwascat | 560 | 486 | 层1 | NHGRI-EBI GWAS目录 | SZGR 2.0页Gwascat | |
CV:GWASDB | 560 | 2130 | 层1 | gwasdb | SZGR 2.0页GWASDB | |
简历:PGC128 | 128 | 148 | 层1 | 精神病基因组学联盟(PGC) | pgc128的SZGR 2.0页 | |
简历:Phewas | 128 | 148 | 层1 | Phewas | phewas的SZGR 2.0页 | |
简历:RIPKE_2013 | 128 | 27 | 层1 | PubMed | ||
简历:PGCNP | 128 | 27 | 2级 | 精神病基因组学联盟(PGC) | 关联 | |