Rehan Akbani
常规成员
副教授
德克萨斯大学医学博士安德森癌症中心
生物信息学和计算生物学系
Rehan Akbani博士致力于从事高调大规模基因组学项目，例如癌症基因组地图集（TCGA）和NCI癌症基因组中心（CCG）的其他项目，对（I）蛋白质组学的双重强调分析（主要是通过反相蛋白质组学阵列； RPPA）和（ii）癌症分子数据集缓解质量控制和批处理效应。他是NCI和DOD的几项赠款的首席研究员（PI）。Akbani博士领导了基于CCG的反相蛋白阵列（RPPA）基于MD Anderson的Gordon Mills博士实验室生产的基于CCG的反相蛋白阵列（RPPA）的质量控制。他还领导CCG的总体数据质量控制和批处理效果工作。除这些项目外，Akbani博士是胃癌研究项目的PI，其目标是确定胃癌中的生物标志物和途径破坏。beplay苹果手机能用吗该项目将胃癌与其他GI癌症进行比较，以了解其生物学。此外，Akbani博士领导了几个TCGA项目，尤其是Pan-Gynecologic Cancers努力和Pan-Cancer TGF-Beta途径项目，该项目研究了这些肿瘤类型或途径中的分子畸变。他实验室中的学生可以期望在这样的备受瞩目的项目中工作，在那里他们可以学习（i）如何使用基因组，蛋白质组学和其他分子数据集，（ii）如何执行质量控制和批处理效果在数据中效果缓解数据。，（iii）在胃，妇科和其他癌症中进行尖端生物信息学研究，（iv）详细研究了几种途径，例beplay苹果手机能用吗如TGF-beta途径。
出版物
- 缺少RTK/RAS/RAF途径的肺腺癌的全基因组表征
- 作者校正：在746个癌症样品中对整个外显子组和基因组突变调用的回顾性评估
- 癌细胞系中临床相关蛋白的药物反应的大规模表征
- 在746个癌症样品中对整个外显子组和基因组突变调用的回顾性评估
- 致癌突变过程中的性别差异
- Pan-Cancer患者和细胞系Interactome的个性化网络建模
- 交互式聚集热图构建器：一种简单的基于网络的工具，用于创建复杂的聚集热图
- 整个基因组的泛伴奏分析
- SAMMI：用于可视化代谢网络的半自动化工具
- 生成RAW RPPA数据及其转换为可以分析的数据
- 分析平台3：通过RPPA管道处理样品以生成大规模数据以进行临床研究
- TP53基因和途径改变癌症基因组图集的综合分析
- Nexus：贝叶斯同时跨样本量的网络估计
- 鉴定和验证宫颈癌的预后蛋白质组学特征
- 癌症的免疫景观
教育与培训
德克萨斯大学圣安东尼奥分校博士，2009年