保罗·谢图
常规成员
教授
德克萨斯大学医学博士安德森癌症中心
流行病学系
我的主要研究涉及beplay苹果手机能用吗开发用于分析人口遗传数据的统计方法。具体而言，我使用链接不平衡（LD）的模型，并开发应用程序以正确考虑附近基因座之间的依赖性。这些应用包括单倍型推理，缺失基因型插补，疾病映射，基因型误差检测和校正，单倍型变异的可视化以及新兴数据类型的整合，例如下一代DNA测序。对于这些应用程序，我维护了一个名为Fastphase的广泛使用的软件包。
我实验室的轮换可以使学生接触几个基于单倍型的软件包（例如阶段，快速，小猎犬和马赫），在此过程中，可以帮助评估LD的不同模型用于各种应用程序和设置。这些模型依赖于隐藏的马尔可夫模型（HMM）技术，而隐含的学生将获得一些介绍以及算法，例如Baum-Welch，Markov Chain Chain Monte Carlo和Expectation-Maximization。此外，学生可以进行动手数据分析，并将获得与Perl和统计软件R合作的经验。具有强大C编程技能的学生可以开发，测试和添加一个功能，以分析为现有软件包。
流行病学系为学生和博士后提供了空间，并在计算遗传流行病学部分提供了丰富的学术氛围。存在充足的计算支持，包括支持遗传分析程序的处理器以及标准编程和数据库管理语言。
教育与培训
博士- 华盛顿大学 - 2006年