Jiqian Wu博士实验室

WU实验室结合了涉及基因组学,生物信息学和功能测定的神经科学,干细胞生物学和基于系统的方法,以揭示基因转录和调节机制。我们通过RNA-Seq对八种高度纯化的神经元,神经胶质和血管细胞进行了前所未有的转录组分析。我们发现了许多新型长的非编码RNA(LNCRNA),我们的功能和遗传实验首次证实了lncRNA在少突胶质细胞前体细胞(OPC)形成中的作用。

我们小组的一个主要重点是研究机制,并为脊髓损伤和神经系统疾病开发有效且安全的治疗。我们已经在小鼠和大鼠模型中发表了多个急性和慢性脊髓损伤阶段中的蛋白质编码和LNCRNA基因表达。我们提供了前所未有的数据源和强大的分析框架,用于对CNS细胞类型中LNCRNA的功能研究。我们还存入了纯化的脑细胞类型的数据集和数据库中的脊髓损伤使用交互式Web浏览器展示,用于分析和比较蛋白质编码,lncRNA基因转录以及替代剪接曲线。它是研究界广泛使用的数据源。beplay苹果手机能用吗

我们研究的另一个领域在于使用综合基因组和蛋白beplay苹果手机能用吗质组学方法的茎和祖细胞自我更新和分化的调节网络的研究。我们的目标是识别和调节关键调节剂作为治疗目标。

关于吴博士

Jiaqian Wu博士是Uthealth的McGovern医学院的Vivian L. Smith神经外科和再生医学中心的任期的副教授。Wu博士在休斯敦的贝勒医学院获得了分子和人类遗传学博士学位。她的研究集中在新型的beplay苹果手机能用吗哺乳动物基因发现和转录组复杂性的表征上。Wu博士领导了NIH哺乳动物基因收集工作,并克隆了数千个哺乳动物基因,这些基因现在可以通过GE Dharmacon公开获得。在耶鲁大学和斯坦福大学的博士后培训期间,Wu博士采用了包括分子和细胞生物学以及基因组学在内的跨学科方法,以研究干细胞自我更新和分化的基因表达,转录因子调节以及调节网络。她是最早使用RNA-Seq表征干细胞神经分化过程的人之一。Dr. Wu’s work has been recognized with prestigious honors and awards, including the National Institutes of Health Ruth L. Kirschstein National Research Service Award for Individual Postdoctoral Fellows, and the International Society for Stem Cell Research (ISSCR) Annual Meeting Travel Award, the National Institute of Health Pathway to Independence (PI) Award (K99/R00), R01 and the Senator Lloyd and B.A. Bentsen Investigator Award. A reviewer for NIH, New York State Department of Health-Spinal Cord Injury Research Board, MRC, ANR, and various journals such as Nature Communications, Nature Biotechnology, Cell Reports and Cell Systems, Dr. Wu has presented invited talks and lectures at national and international conferences, universities and institutions. She has developed a patent, authored two books, and wrote many articles that have appeared in PNAS, the Journal of Neuroscience, Stem Cell Reports, Plos Genetics, Genome Research, Genome Biology, Nature Materials and Nature, among others.

beplay苹果手机能用吗研究项目

  • 研究干细胞分化过程中的基因表达和调节机制
  • 表征分子特征并确定脊髓损伤和神经疾病的治疗靶标
  • 查明关键转录因子和调节性RNA,并调节关键调节器以指导干细胞分化的方向并提高效率
  • 确定前体细胞自我更新和分化的分子转换
  • 干细胞分化的网络分析和多种类型的OMIC数据的全局网络集成

团队成员

Haichao Wei博士,博士后研究员
博士研究生Xizi Wu,医学博士
博士博士学位,博士后研究员
Vy Hong,本科生
Eyad Shihabeddin,旋转学生

联系实验室

电子邮件:jiaqian.wu@uth.tmc.edu
办公室电话:(713)500-3421

最新出版物(选定)

    1. Wu,J。Q.,Habegger,L.,Noisa,P.,Szekely,A.,Qiu,C.,Hutchison,S.,Raha,D.,Lin,H.,Egholm,M.,Weissman,S.,Cui,W.,Gerstein,M。和Snyder,M。(2010年)。通过整合短,长和配对的测序,在人类胚胎干细胞的神经分化过程中的动态转录组。PNAS。107:5254-5259。
    2. Wu,J。Q.,Seay,M.,Schulz,V.,Hariharan,M.,Tuck,D.,Lian,J.,Du,J.,Shi,M.,Ye,Z.J.,Gerstein,M.,Snyder,M.,M.,M.,和Weissman,S。(2012)。TCF7是多能造血细胞系中自我更新和分化开关的关键调节剂。PLOS Genet 8(3):E1002565。PMC3297581
    3. Zhang, Y., Chen, K., Sloan, S., Bennett, M., Scholze, A., O’Keeffe, S., Phatnani, H., Guarnieri, P., Caneda, C., Ruderisch, N., Deng, S., Liddelow, S., Zhang, C., Daneman, R., Maniatis, T., Barres, B.,Wu,J.Q。(2014)大脑皮层神经元,神经胶质和血管细胞的RNA-SEQ转录组和剪接数据库。J. Neurosci。,34(36):11929-11947。PMID:25186741
    4. Yan,Q.,Weyn-Vanhentenryck,S.M.,Wu,J.,Sloan,S.,Zhang,Y.,Chen,K.Wu,J。Q.,Bars,B.,Zhang,C。(2015)哺乳动物大脑中调节和保守的替代外显子的系统发现揭示了NMD调节染色质调节剂。PNAS。3月17日; 112(11):3445-50
    5. 构建神经系统的RNA测序跨曲子。Dong,X.,You,Y。和吴,JQ。神经科学家。2015年10月13日。PMID:26463470
    6. 从大脑纯化的细胞类型中对长的非编码RNA的全面鉴定揭示了OPC命运测定中的功能性LNCRNA。Dong,X.,Chen,KN,Duran,R.,You,Y。Sloan,S.,Ye,Z.,Zong,S.,Cao,Q.吴,JQ。PLOS基因。2015年12月18日; 11(12):E1005669。
    7. 在脊髓损伤的亚尚元和慢性阶段进行编码和长期非编码RNA的系统分析。Cuevas-Diaz Duran,R.,Yan,H.,Zheng,Y.,Huang,X.,Grill,R.,Kim,D.H.,Cao,Q。和吴,JQ。Sci代表1月20日; 7:41008。doi:10.1038/srep41008。2017
    8. Cuevas-Diaz Duran R,Wang CY,Zheng H,Deneen B,吴JQ。大脑区域特异性基因特异性基因特异性基因由不同的星形胶质细胞亚群揭示了与神经胶质瘤和神经退行性疾病的联系。Eneuro。2019年4月2日; 6(2)。doi:10.1523/eneuro.0288-18.2019。PMID:30957015。
    9. He,L.,Zhou,J.,Chen,M.,Lin,C.,Kim,S.G.,Zhou,Y.,Xiang,L.,C.,Coelho,P.G.,Bromage,T.G.,Hu,B.,Tovar,N.,Witek,L.,吴,J。Gong,Q.,Owens,D.M.,Stanislauskas,M.,Pei,J.,Chotkowski,G.,Wang,S.,Yang,G.,Shelanski,M.,Zegarelli,D.J.X.,Finkel,M.,Zhang,W.,Li,J.,Cheng,J.,Tarnow,D.P.,Zhou,X.,Wang,Z.,Jiang,X.,Romanov,A.,Wang,S.。, Ye, L., Ling, J., Mao, J. J. Parenchymal and Stromal Tissue Regeneration of Tooth Organ by Pivotal Signals Reinstated in Decellularized Matrix. Nature Materials. 2019 Jun;18(6):627-637. doi: 10.1038/s41563-019-0368-6. PMID:31114073
    10. Kobayashi,M.,Tarnawsky,S.P.,Wei,H.,Mishra,A.,Azevedo Portilho,N.,Wenzel,P.,Davis,B.,B.,B.,B.,B.,吴,J。干细胞报告。2019年6月10日。PII:S2213-6711(19)30193-6。doi:10.1016/j.stemcr.2019.05.025。PMID:31231025

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