癌症基因组学中心

致癌基因组学


单细胞RNA测序(SCRNA-SEQ)服务

CGC使用10倍基因组铬系统与Illumina测序机相结合提供单细胞RNA测序服务。10倍系统使得可以介绍数千个单元格。这是从10x基因组学引入SCRNA-SEQ的Web链接:

样本准备指南

服务 样本类型 最低金额 最小细胞活力
scrna-seq 细胞 106 85%

*有关样品准备的更多详细信息,请与我们联系。
*请使用量子量来测量DNA/RNA浓度。
*如果可用,请为您的样品提供生物分析仪的结果。


服务工作流程

服务工作流程图SCRNA-SEQ



分析管道(通用)

分析管道SCRNA-SEQ图
我们团队的相关出版物:

  1. Braga Fav,Vieira Braga FA,Kar G,Berg M,Carpaij OA,Polanski K等。健康肺和哮喘气道壁的细胞普查确定了健康和疾病中的新细胞状态。生物xiv。2019。
  2. Wolf FA,Alexander Wolf F,Hamey FK,Plass M,Solana J,Dahlin JS等。PAGA:图形抽象通过保留单个单元的拓扑结构来调解聚类与轨迹推断。基因组生物学。2019。
  3. Angelidis I,Simon LM,Fernandez IE,Strunz M,Mayr CH,Greiffo FR等。由单细胞转录组学和深层组织蛋白质组学映射的衰老肺的地图集。纳特社区。2019。
  4. Eraslan G,Simon LM,Mircea M,Mueller NS,Theis FJ。单细胞RNA-seq denosing使用深度计数自动编码器。纳特社区。2019。
  5. Krendl C,Shaposhnikov D,Rishko V,Ori C,Ziegenhain C,Sass S等。GATA2/3-TFAP2A/C转录因子网络夫妻伴侣人类多能干细胞分化与滋养剂,并抑制多能性。PNAS。2017。
  6. Angerer P,Simon L,Tritschler S,Alexander Wolf F,Fischer D,Theis FJ。单细胞构成大数据:转录组学方面的新挑战和机会。当前的系统生物学意见。2017。
  7. Cao Y,Zhu J,Jia P,Zhao Z. scrnaseqdb:一个基于RNA-Seq的基因表达谱的数据库,该数据库中人类单细胞中的基因表达谱。基因。2017。
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