校友
2021毕业生
Chen,Jiun-Sheng(Chad Huff博士)
Srinivasan,Sanjana(Giulio Draetta博士)
2020年毕业生
Ramesh,Naveen(Nick Navin博士)
Lenoir,Walter(Traver Hart博士)
戴维斯,亚历山大(尼克·纳文博士)
Zhou,Yanhong(J. Jack Lee博士)
2019年毕业生
Yang,Jie(Erik Sulman博士)
夏,方(Xuelin Huang博士)
Sivakumar,Smruthy(Paul Scheet博士)
2018年毕业生
张,Youyi(Jeffrey Morris博士)
刘,Yihua(Paul Scheet博士)
周,亨(Ying Yuan博士)
校友出版物
亚历山大·戴维斯(Alexander Davis)
单细胞DNA测序揭示了转移性结直肠癌中的延迟截止性模型。
Leung ML,戴维斯A。,Gao R,Casasent A,Wang Y,Sei E,Vilar E,Maru D,Kopetz S,Navin NE。
基因组res。2017年8月; 27(8):1287-1299。doi:10.1101/gr.209973.116。EPUB 2017年5月25日。
PMID:28546418
*肿瘤的演化:线性,分支,中性还是标点?
戴维斯A。,Gao R,Navin N.
Biochim Biophys Acta。2017年4月; 1867(2):151-161。doi:10.1016/j.bbcan.2017.01.003。EPUB 2017年1月19日。评论。
PMID:28110020
三阴性乳腺癌中的标点拷贝数进化和克隆滞留。
gao r,戴维斯A。,麦当劳(McDonald to),Sei E,Shi X,Wang Y,Tsai PC,Casasent A,Waters J,Zhang H,Meric-Bernstam F,Michor F,Navin NE。
NAT遗传学。2016年10月; 48(10):1119-30。doi:10.1038/ng.3641。Epub 2016 8月15日。
PMID:27526321
*从单细胞计算肿瘤树。
戴维斯A。,nawin ne。
基因组生物。2016年5月26日; 17(1):113。doi:10.1186/s13059-016-0987-Z。
PMID:27230879
沃尔特·弗兰克·莱诺尔(Walter Frank Lenoir)
A网络的人类功能基因互动从昏死健康屏幕在癌细胞
Eiru Kim,Merve Dede,沃尔特·莱诺尔(Walter F Lenoir),Gang Wang,Sanjana Srinivasan,Medina Colic,Traver Hart
生命科学联盟。2019年4月;2(2):E201800278。在线发布2019年4月12日。DOI:10.26508/LSA.201800278
PMCID:PMC6464042
*泡菜:合并的Vitro CRISPR敲除库的数据库。
Lenoir WF,Lim TL,Hart T.
核酸res。2018年1月4日; 46(D1):D776-D780。doi:10.1093/nar/gkx993。
PMID:29077937
DNA聚合酶i通过抵抗DNA复制应力来补偿范科尼贫血途径缺乏症
王王,沃尔特·莱诺尔(Walter F. Lenoir),Chao Wang,Dan Su,Megan McLaughlin,Qianghua Hu,Xi Shen,Yanyan Tian,Naeh Klages-Mundt,Erica Lynn,Richard D. Wood,Junjie Chen,Traver Hart,Lei Li Li Li
2020年12月,202008821年12月,美国国家科学院论文集;doi:10.1073/pnas.2008821117
Yihua Liu
*鉴定二分化DNA甲基化数据的阈值。
刘,Ji Y,Qiu P.
EURASIP J Bioinform Syst Biol。2013年6月6日; 2013(1):8。doi:10.1186/1687-4153-2013-8。
PMID:23742247
纳文·拉梅什(Naveen Ramesh)
*通过血浆基因组测序解码对前列腺癌治疗的进化反应
Ramesh N,Sei E,Tsai PC,Bai S,Zhao Y,Troncoso P,Corn PG,Logothetis C,Zurita AJ,Navin NE。通过血浆基因组测序解码对前列腺癌治疗的进化反应。基因组生物。2020年7月6日; 21(1):162。doi:10.1186/s13059-020-02045-9
PMID:32631448;PMCID:PMC7336456
Smruthy Sivakumar
肺癌发病机理中的TBX2亚家族抑制:一种用于早期检测的高电位标记。
Khalil aa,Sivakumar s,Lucas Fas,McDowell T,Lang W,Tabata K,Fujimoto J,Yatabe Y,Spira A,Scheet P,Nemer G,Kadara H.
Oncotarget。2017年8月4日; 8(40):68230-68241。doi:10.18632/oncotarget.19938。2017年9月15日。
PMID:28978111
*非典型腺瘤增生的基因组景观揭示了与肺腺癌不同的模式。
Sivakumar s,Lucas Fas,McDowell TL,Lang W,Xu L,Fujimoto J,Zhang J,Futreal PA,Fukuoka J,Yatabe Y,Dubinett SM,Spira AE,Fowler J,Hawk J,Hawk Et,Wistuba II,Wistuba II,Scheet P,Scheet P,Kadara H.
癌症。2017年11月15日; 77(22):6119-6130。doi:10.1158/0008-5472.CAN-17-1605。EPUB 2017年9月26日。
PMID:28951454
用Haplohseq从外显子组测序数据中快速而有力地检测出微妙的等位基因失衡。
圣卢卡斯·弗纳(San Lucas FA),Sivakumar s,Vattathil S,Fowler J,Vilar E,Scheet P.
生物信息学。2016年10月1日; 32(19):3015-7。doi:10.1093/bioinformatics/btw340。EPUB 2016年6月10日。
PMID:27288500
Youyi Zhang
人类乳头瘤病毒状况预测的放射分析。
Yu K,张Y,Yu Y,Huang C,Liu R,Li T,Yang L,Morris JS,Baladandayuthapani V,Zhu H.
Clin Transl radiat Oncol。2017年11月6日; 7:49-54。doi:10.1016/j.ctro.2017.10.001。2017年12月的环保。
PMID:29594229
亨周
*新型I期试验设计的准确性,安全性和可靠性。
周,Yuan Y,Nie L.
Clin Cancer Res。2018年4月16日。PII:Clincanres.0168.2018。doi:10.1158/1078-0432.CCR-18-0168。[EPUB在印刷前]
PMID:29661774
*BOP2:具有简单和复杂端点的II期临床试验的贝叶斯最佳设计。
周,Lee JJ,Yuan Y.
Stat Med。2017年9月20日; 36(21):3302-3314。doi:10.1002/sim.7338。EPUB 2017年6月7日。
PMID:28589563